O preparo para o exame é bem simples, e se assemelha ao preparo para o exame de endoscopia digestiva alta.

Basicamente consiste no jejum de 8 horas, inclusive para líquidos. Preferencialmente, na noite anterior ao exame faça uma dieta leve.

As medicações de uso contínuo já utilizadas pelo paciente devem ser avaliadas individualmente à critério do médico, mantendo-as ou suspendendo-as até o termino do procedimento.