Você pode continuar tomando a maioria das medicações como de costume até o dia do exame.

Avise o seu médico sobre quaisquer medicamentos que você estiver tomando e sobre qualquer alergia que tenha a medicação.Medicamentos anticoagulantes (heparina ou coumadin) podem precisar ser ajustados antes do exame.

Medicamentos para controle da diabetes deverão ser utilizados no dia do exame  conforme orientação do médico endoscopista.

Verifique com o seu médico sobre cada medicação que você deve tomar na manhã da ecoendoscopia e tome a medicação essencial com apenas um pequeno copo de água. Se você tem alergia a látex, você deve informar anteriormente ao médico.

Antibióticos geralmente não são necessários antes ou depois da ecoendoscopia.  Caso o médico julgue necessário, poderá usar antibióticos durante a Ecoendoscopia ou depois do procedimento para ajudar a prevenir infecções.

Novamente, avise o seu médico sobre qualquer alergia a medicamento.

Se você recebeu sedativo, você não vai poder dirigir após o procedimento mesmo que não se sinta cansado. Você deve conseguir uma carona para casa. Você também deve planejar ter alguém com você em casa depois do exame devido ao fato dos sedativos poderem afetar o seu julgamento e reflexos pelo resto do dia.

A prática varia de acordo com os médicos, mas para um exame de ecoendoscopia do trato gastrointestinal alto, seu endoscopista pode borrifar a sua garganta com anestésico local antes do exame começar.

Geralmente você receberá sedativos intravenosos para ajudá-lo a relaxar. Você provavelmente começará deitando do seu lado esquerdo. Após receber sedativo o seu endoscopista começará a passar a sonda de ultrassom endoscópico pela sua boca, esôfago e estômago até o duodeno. O instrumento não interfere a sua capacidade respiratória. O procedimento em si, geralmente leva em média quarenta minutos.

Se você recebeu sedativo, você será monitorado na área de recuperação até a maior parte do efeito do medicamento passar. Se você fez uma ecoendoscopia do trato alto, sua garganta pode ficar um pouco dolorida. Você pode se sentir inchado por causa do ar e água que foram introduzidos durante o exame. Você estará apto a comer depois que deixar a área de procedimento a menos que seja instruído o contrário. Seu médico geralmente pode informá-lo do resultado do procedimento no dia, mas o resultado de alguns testes pode durar vários dias.

Geralmente todos os medicamentos podem e devem ser mantidos exceto aqueles que interferem no processo de coagulação sangüínea, portanto o AAS (Aspirina), anti-coagulantes orais e venosos podem ser suspensos alguns dias antes do procedimento ou substituídos por outros segundo orientação do seu médico.

A ecoendoscopia é um procedimento com baixos índices de complicações.

Em casos de punção com agulha fina, apesar de raro, pode ocorrer sangramento no local da punção, pancreatite, perfuração e infecção de cistos, que na maioria das vezes não exige tratamento cirúrgico.